MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp32-3

Total Repeats: 658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000949	GT	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	11497136
2	NC_000949	AAAAC	2	10	81	90	80 %	0 %	0 %	20 %	11497136
3	NC_000949	T	6	6	135	140	0 %	100 %	0 %	0 %	11497136
4	NC_000949	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497136
5	NC_000949	TGC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497136
6	NC_000949	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497136
7	NC_000949	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497136
8	NC_000949	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497136
9	NC_000949	AT	3	6	504	509	50 %	50 %	0 %	0 %	11497136
10	NC_000949	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	11497136
11	NC_000949	TAGAAA	2	12	598	609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	11497136
12	NC_000949	T	6	6	629	634	0 %	100 %	0 %	0 %	11497136
13	NC_000949	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497136
14	NC_000949	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497136
15	NC_000949	AAT	2	6	717	722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497136
16	NC_000949	TCT	2	6	744	749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497136
17	NC_000949	T	6	6	749	754	0 %	100 %	0 %	0 %	11497136
18	NC_000949	AAT	2	6	855	860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497136
19	NC_000949	TTA	2	6	904	909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497136
20	NC_000949	AGG	2	6	931	936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497136
21	NC_000949	ATTA	2	8	944	951	50 %	50 %	0 %	0 %	11497136
22	NC_000949	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497136
23	NC_000949	ATT	2	6	1048	1053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497136
24	NC_000949	GAA	2	6	1161	1166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497136
25	NC_000949	TAA	2	6	1241	1246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497136
26	NC_000949	GAG	2	6	1248	1253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497136
27	NC_000949	ATT	2	6	1274	1279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497136
28	NC_000949	AGA	2	6	1317	1322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497137
29	NC_000949	AGA	2	6	1326	1331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497137
30	NC_000949	AGA	2	6	1350	1355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497137
31	NC_000949	GCA	2	6	1356	1361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497137
32	NC_000949	GTTC	2	8	1677	1684	0 %	50 %	25 %	25 %	11497137
33	NC_000949	GA	3	6	1739	1744	50 %	0 %	50 %	0 %	11497137
34	NC_000949	ATTAA	2	10	1780	1789	60 %	40 %	0 %	0 %	11497137
35	NC_000949	A	6	6	1791	1796	100 %	0 %	0 %	0 %	11497137
36	NC_000949	AGC	2	6	1804	1809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497137
37	NC_000949	TCT	3	9	1810	1818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497137
38	NC_000949	AGA	2	6	1854	1859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497137
39	NC_000949	ATAC	2	8	1928	1935	50 %	25 %	0 %	25 %	11497137
40	NC_000949	CAA	2	6	2086	2091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497138
41	NC_000949	T	6	6	2141	2146	0 %	100 %	0 %	0 %	11497138
42	NC_000949	TGG	2	6	2154	2159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497138
43	NC_000949	AAC	2	6	2250	2255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497138
44	NC_000949	TGG	3	9	2274	2282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497138
45	NC_000949	GT	3	6	2299	2304	0 %	50 %	50 %	0 %	11497138
46	NC_000949	AAGA	2	8	2380	2387	75 %	0 %	25 %	0 %	11497138
47	NC_000949	TAAAT	2	10	2415	2424	60 %	40 %	0 %	0 %	11497138
48	NC_000949	CA	3	6	2498	2503	50 %	0 %	0 %	50 %	11497138
49	NC_000949	ATTT	2	8	2516	2523	25 %	75 %	0 %	0 %	11497138
50	NC_000949	TGCT	2	8	2528	2535	0 %	50 %	25 %	25 %	11497138
51	NC_000949	TAA	2	6	2566	2571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497138
52	NC_000949	GCT	2	6	2656	2661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497139
53	NC_000949	GCAA	2	8	2676	2683	50 %	0 %	25 %	25 %	11497139
54	NC_000949	TGA	2	6	2739	2744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497139
55	NC_000949	AGT	2	6	2815	2820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497139
56	NC_000949	TA	3	6	2964	2969	50 %	50 %	0 %	0 %	11497139
57	NC_000949	CTGATA	2	12	2984	2995	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	11497139
58	NC_000949	ATGT	2	8	3014	3021	25 %	50 %	25 %	0 %	11497139
59	NC_000949	GTAT	2	8	3039	3046	25 %	50 %	25 %	0 %	11497139
60	NC_000949	ATAA	2	8	3121	3128	75 %	25 %	0 %	0 %	11497139
61	NC_000949	TTA	2	6	3137	3142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497139
62	NC_000949	CCA	2	6	3160	3165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	11497139
63	NC_000949	AT	3	6	3178	3183	50 %	50 %	0 %	0 %	11497139
64	NC_000949	CAAT	2	8	3203	3210	50 %	25 %	0 %	25 %	11497139
65	NC_000949	TGG	2	6	3330	3335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497139
66	NC_000949	ATT	2	6	3968	3973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497125
67	NC_000949	TGA	2	6	3974	3979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497125
68	NC_000949	ATT	2	6	3982	3987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497125
69	NC_000949	TAT	2	6	4031	4036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497125
70	NC_000949	A	6	6	4093	4098	100 %	0 %	0 %	0 %	11497125
71	NC_000949	ACA	2	6	4134	4139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497125
72	NC_000949	ATT	2	6	4201	4206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497125
73	NC_000949	AT	3	6	4271	4276	50 %	50 %	0 %	0 %	11497125
74	NC_000949	TAA	3	9	4286	4294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497125
75	NC_000949	AGT	2	6	4329	4334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497125
76	NC_000949	ATT	2	6	4338	4343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497125
77	NC_000949	TTA	2	6	4348	4353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497125
78	NC_000949	GCT	2	6	4433	4438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497125
79	NC_000949	AGA	2	6	4460	4465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497125
80	NC_000949	GTG	2	6	4474	4479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497125
81	NC_000949	CGA	2	6	4544	4549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497125
82	NC_000949	GAT	2	6	4562	4567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497125
83	NC_000949	GCA	3	9	4614	4622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497125
84	NC_000949	GCA	2	6	4629	4634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497125
85	NC_000949	AGT	2	6	4635	4640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497125
86	NC_000949	TAA	2	6	4685	4690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497125
87	NC_000949	AGA	2	6	4694	4699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497125
88	NC_000949	TTA	2	6	4765	4770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497125
89	NC_000949	CTAC	2	8	4794	4801	25 %	25 %	0 %	50 %	11497125
90	NC_000949	TCAT	2	8	4841	4848	25 %	50 %	0 %	25 %	11497125
91	NC_000949	CTA	2	6	4879	4884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497125
92	NC_000949	GAA	3	9	4981	4989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365257007
93	NC_000949	TACT	2	8	5150	5157	25 %	50 %	0 %	25 %	365257007
94	NC_000949	GTT	2	6	5194	5199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	365257007
95	NC_000949	GAATTT	2	12	5203	5214	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	365257007
96	NC_000949	A	6	6	5224	5229	100 %	0 %	0 %	0 %	365257007
97	NC_000949	TGAACT	2	12	5241	5252	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	365257007
98	NC_000949	ATT	2	6	5255	5260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365257007
99	NC_000949	TAG	2	6	5265	5270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365257007
100	NC_000949	GAA	2	6	5281	5286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365257007
101	NC_000949	GGC	2	6	5287	5292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	365257007
102	NC_000949	TG	3	6	5380	5385	0 %	50 %	50 %	0 %	365257007
103	NC_000949	AATG	2	8	5396	5403	50 %	25 %	25 %	0 %	365257007
104	NC_000949	TGT	2	6	5489	5494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	365257008
105	NC_000949	TTC	2	6	5510	5515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365257008
106	NC_000949	AG	3	6	5521	5526	50 %	0 %	50 %	0 %	365257008
107	NC_000949	TTA	2	6	5563	5568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365257008
108	NC_000949	TGG	2	6	5812	5817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497128
109	NC_000949	TAG	2	6	5893	5898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497128
110	NC_000949	AT	3	6	5914	5919	50 %	50 %	0 %	0 %	11497128
111	NC_000949	AAT	2	6	5921	5926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497128
112	NC_000949	TA	3	6	5930	5935	50 %	50 %	0 %	0 %	11497128
113	NC_000949	CTA	2	6	6014	6019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497128
114	NC_000949	AAGT	2	8	6061	6068	50 %	25 %	25 %	0 %	11497128
115	NC_000949	GTA	2	6	6078	6083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497128
116	NC_000949	GCA	2	6	6089	6094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497128
117	NC_000949	TTG	2	6	6102	6107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497128
118	NC_000949	AAT	2	6	6229	6234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497129
119	NC_000949	ATC	2	6	6263	6268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497129
120	NC_000949	GCT	2	6	6289	6294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497129
121	NC_000949	ATA	2	6	6304	6309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497129
122	NC_000949	AT	4	8	6406	6413	50 %	50 %	0 %	0 %	11497129
123	NC_000949	TAA	2	6	6546	6551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497129
124	NC_000949	AGG	2	6	6686	6691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497129
125	NC_000949	TAG	2	6	6751	6756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497141
126	NC_000949	ATT	2	6	6762	6767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497141
127	NC_000949	TAA	2	6	6808	6813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497141
128	NC_000949	TGC	2	6	6817	6822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497141
129	NC_000949	TAA	2	6	6850	6855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497141
130	NC_000949	AATGGA	2	12	6890	6901	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	11497141
131	NC_000949	GAAAA	2	10	6915	6924	80 %	0 %	20 %	0 %	11497141
132	NC_000949	A	6	6	6921	6926	100 %	0 %	0 %	0 %	11497141
133	NC_000949	T	6	6	6952	6957	0 %	100 %	0 %	0 %	11497141
134	NC_000949	GAA	2	6	6968	6973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497141
135	NC_000949	A	6	6	7024	7029	100 %	0 %	0 %	0 %	11497141
136	NC_000949	AC	3	6	7048	7053	50 %	0 %	0 %	50 %	11497141
137	NC_000949	TGT	2	6	7057	7062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497141
138	NC_000949	TTA	2	6	7065	7070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497141
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